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操作人員使用全自動氮吹儀之前，應當熟悉工程流程和步驟。氮吹濃縮儀快速濃縮要求掌握樣品量、氮氣流速、水浴溫度和針位之間的平衡。使用不當，將會事倍功半，甚至污染樣品或造成樣品損失。同時要注意通風櫥內空氣的污染程度、氮氣純度、樣品運輸過程等環境條件。

2)水浴操作
(1)打開水浴電源開關。
(2)設定水浴溫度。按溫度設定顯示板上的左邊個鍵，上排顯示“SP”，再按“∧”或“∨”，是下排顯示為所需設定的溫度值，再但左邊個鍵返回。通常水浴溫度應小于溶劑沸點溫度2-3℃。
3)氮吹儀操作。
(1)將全自動氮吹儀提升到位置，并鎖緊。
(2)將樣品試管放置到樣品定位架上，用樣品定位架彈簧固定試管，試管底部處于支撐托盤上，記錄樣品所放位置。如果支撐托盤過低，則擰松支撐托盤中心環上的兩個定位螺釘。上升支撐托盤，直到試管底部位于托盤上，距定位架不低于15mm。調整支撐托盤，使狹縫對準試管。再次擰緊定位螺釘，固定支撐托盤。
(3)安裝不銹鋼針頭，直接套上即可。
(4)打開氮氣瓶，調節流量計為氮吹儀送氣。氮氣只需開一點點，否則壓力過大會把管路沖開。調節流量計至所需壓力。
(5)降低針頭，直到針頭距離溶液表面6mm。調整：擰開配氣盤上的鎖緊螺母，針閥管便可上下滑動，調整好高度，擰緊鎖緊螺母。
(6)打開所用樣品位的流量閥。氮吹濃縮儀打開流量閥時，逆時針旋轉1/8到1/6圈即可，不要旋轉幅度過大，以防針閥螺母脫落，安裝時，應按順時針旋轉。
(7)濃縮樣品前，建議氮氣空吹5-10min，以防氮吹儀氣路中殘留雜質氣體。
(8)調節流量計到全自動氮吹儀所需的流速。氮吹開始，用針頭上面的流量閥微調流速。并監測供氣壓力，不得超過200Kpa。調節流量閥，使氣流在樣品表面產生波紋，但應防止飛濺。
(9)連續汽化直至完成。根據非干性邊界點要求，必須監測汽化，到達所期望的邊界點后移走樣品。
(10)汽化完成時，使用干凈的吸管，用一兩滴溶劑沖洗不銹鋼針頭。
(11)向上滑動針閥管，從樣品定位架移走樣品試管。
(12)汽化完成后關閉氣源。
(13)關掉流量計和流量閥。
(14)關掉水浴電源。
(15 )卸下不銹鋼針頭。